Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp12O08736 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms