Protein–RNA interactions for Protein: O08586

Pten, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtenO08586 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtenO08586 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtenO08586 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtenO08586 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtenO08586 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtenO08586 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtenO08586 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtenO08586 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtenO08586 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtenO08586 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtenO08586 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtenO08586 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtenO08586 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtenO08586 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtenO08586 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtenO08586 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtenO08586 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtenO08586 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms