Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3488M0QW81 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3488M0QW81 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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