Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6871L7N248 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm6871L7N248 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6871L7N248 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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