Protein–RNA interactions for Protein: L7N1X0

Gm28044, Predicted gene, 28044, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28044L7N1X0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28044L7N1X0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28044L7N1X0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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