Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn2r88L7N1W8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r88L7N1W8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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