Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21310J3QQ23 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21310J3QQ23 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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