Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm20877J3QPZ4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm20877J3QPZ4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm20877J3QPZ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Gm20877J3QPZ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20877J3QPZ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20877J3QPZ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm20877J3QPZ4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms