Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5730507C01RikJ3QPX0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5730507C01RikJ3QPX0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
5730507C01RikJ3QPX0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms