Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm9602J3QPD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms