Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21060J3KMU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms