Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17ldG5E8G2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17ldG5E8G2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17ldG5E8G2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms