Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933406M09RikG3XA12 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933406M09RikG3XA12 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms