Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r58G3X9U3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r58G3X9U3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms