Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hmgxb3G3X9M3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms