Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh3tc1G3X9F6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3tc1G3X9F6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3tc1G3X9F6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms