Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nccrp1G3X9C2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nccrp1G3X9C2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nccrp1G3X9C2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms