Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm8909G3UXE9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm8909G3UXE9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8909G3UXE9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms