Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r176G3UW31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r176G3UW31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r176G3UW31 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms