Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4bp2F8VQG7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
N4bp2F8VQG7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
N4bp2F8VQG7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms