Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M1F7CXU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms