Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm28038F7BCN9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm28038F7BCN9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28038F7BCN9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm28038F7BCN9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm28038F7BCN9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm28038F7BCN9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm28038F7BCN9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gm28038F7BCN9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm28038F7BCN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm28038F7BCN9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28038F7BCN9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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