Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm8220F6YKI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm8220F6YKI2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms