Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm10563F6WIE4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gm10563F6WIE4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm10563F6WIE4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm10563F6WIE4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm10563F6WIE4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm10563F6WIE4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm10563F6WIE4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms