Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm28305F6U473 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28305F6U473 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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