Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3072F6SKY8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3072F6SKY8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms