Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm29094F6Q785 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm29094F6Q785 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29094F6Q785 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms