Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf165E9QAU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rnf165E9QAU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms