Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmod3E9QA62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmod3E9QA62 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmod3E9QA62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms