Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc74aE9Q9U8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms