Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TrdnE9Q9K5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrdnE9Q9K5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TrdnE9Q9K5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms