Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col22a1E9Q7P1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col22a1E9Q7P1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col22a1E9Q7P1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms