Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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C6E9Q6D8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C6E9Q6D8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C6E9Q6D8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms