Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc85cE9Q6B2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc85cE9Q6B2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms