Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Setd2E9Q5F9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd2E9Q5F9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms