Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip11E9Q512 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip11E9Q512 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms