Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ApobE9Q414 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ApobE9Q414 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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