Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Susd1E9Q3H4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms