Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r238E9Q373 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r238E9Q373 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r238E9Q373 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r238E9Q373 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r238E9Q373 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms