Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Wdr17E9Q271 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Wdr17E9Q271 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Wdr17E9Q271 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Wdr17E9Q271 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms