Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zfp558E9Q1J0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zfp558E9Q1J0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp558E9Q1J0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms