Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Myo5cE9Q1F5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Myo5cE9Q1F5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo5cE9Q1F5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo5cE9Q1F5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms