Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0R1

Gm8159, Predicted gene 8159, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8159E9Q0R1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8159E9Q0R1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8159E9Q0R1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms