Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms