Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ErmardE9Q048 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ErmardE9Q048 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ErmardE9Q048 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms