Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brd1E9PZ26 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Brd1E9PZ26 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brd1E9PZ26 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms