Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rsph10bE9PYQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph10bE9PYQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms