Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc175E9PVB3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc175E9PVB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc175E9PVB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms