Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde2E9PUP1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syde2E9PUP1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde2E9PUP1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms