Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
3425401B19RikD3Z1D3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
3425401B19RikD3Z1D3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms